为抗击病毒助力,你也可以!加入[email protected]项目参与病毒研究运算!

1.png
简单来讲, 大多数人的PC都有很大一部分闲时,通过[email protected]分布式计算项目,每个人都可以将这一部分算力贡献出来,为抗击病毒,解决医学难题,甚至是寻找外星人做贡献。

什么是[email protected]工程?

[email protected] 是在2000 年10 月1 日正式启动的一项世界上最大的分散式计算计划,通过号召大家GPU闲置时的计算能力,帮助科学家们了解、抵抗病毒。专注于精确地类比蛋白质折叠和错误折叠的过程,以便能更好地了解多种疾病的起因和发展,包括阿兹海默症、亨廷顿舞蹈症、牛海绵状脑病(狂牛症、狂牛症)、癌症和囊胞性纤维症。到目前为止,[email protected] 已成功类比5—10微秒的折叠过程,超出先前估计可类比的时段数千倍。现在 [email protected] 已经上线了肺炎项目,打开 [email protected] 主页,点击“Start Folding Now”,在新的网页中点击“Download Now”即可进入下载页。

2.png
计算框架支持 MAC OS, Android, Windows, Linux等多种平台。
3.png

[email protected] 怎么运作的?

[email protected] 并不是依靠超级电脑来运算,主要是透过全世界成千上万的个人电脑,由用户自愿参加,并在电脑中安装客户端程序,工具就会在系统闲置时,利用CPU 多核和GPU 图型运算来工作,主要是避免电脑平常没在使用时浪费运算能力,如果用户使用时,也不会影响到原本作业,不过会有几项缺点:


比较吃效能(如需要使用时,可以关闭程式),(可以选择Light模式,仅占用很少一部分效能。)
要发挥运算,造成风扇声偏大,(可以选择Light模式,仅占用很少一部分效能。)
比较耗电,如果是笔电会导致电池提早老化
[email protected] 会定时连接设于斯坦福大学的伺服器去取得「工作单元」(work units),即一种存有实验资料的资料包,根据实验资料进行计算。每个工作单元计算完成后,再传回伺服器。

如何使用 [email protected] 加入运算?

进入下载页面,下载安装软件:
4.png
如果你的系统不是Windows,点击页面下方的“alternative downloads”,即可在选择你的操作系统,Mac、Linux常见发行版都能支持,甚至之前“模拟地球”的PS3都支持,希望索尼和微软能够重新将[email protected]带回主机。
5.png
客户端下载安装完成之后,会在后台运行,退出客户端即自动结束。[email protected]运行后会在桌面右下角显示小图标,通过访问 https://client.foldingathome.org/ 就能通过网页方便的控制程序。那么我们怎样设定Covid-19优先计算呢?
WEB控制台
6.png
在网页控制页面的 “I support research fighting” 中选择 “Any Desease”,尽管[email protected]不允许专门为某一个项目贡献算力,但由于现在特殊时期,肺炎相关项目拥有最高优先级,会自动分配给你相关项目计算。
桌面控制端:
7.png
在下载完任务包之后,[email protected]就自动开始计算了,如果大家在工作可以将算力调至中档保证自己工作效率,算力大小也是CPU和显卡性能的一大参考指标。你还可以去 https://apps.foldingathome.org/passkey/create 申请Passkey来获取额外分数奖励。
8.png
Name自己任意填,留下邮箱点击“Get Passkey”即可收到你的专属Passkey,然后再去FAH控制台填入即可。右键FAH图标,选择”FAHControl”,在弹出的界面中点击左上角“Configure”齿轮图标,再选择“Identity”选项卡,填入你刚刚申请的Name和Passkey,Team Number可以填入3213为中国队添砖加瓦
9.png
[email protected] 还涉及到众多计算机等相关知识,而我们贡献出自己电脑的一点算力就已足够,感兴趣的同学可以去项目官网Github等深挖。在电脑贡献出力量之后,我们自己也能凭借自己的聪明才智,帮助科学家们一起对抗病毒。

如何查看自己的积分?

团队积分排行:
目前排名第一的是由开源操作系统Linux领袖领导的团队。中国团队排名第11位
10.png
个人积分:
通过https://stats.foldingathome.org/donor/+自己填入的Name
例如:https://stats.foldingathome.org/donor/Spaceack

什么是Foldit项目?

相比[email protected] 借助算法和算力解决蛋白质折叠问题,Foldit则充分利用人类与生俱来的三维能力和解谜思维。Foldit在2月底上线了肺炎病毒的内容,大家可以通过解谜游戏来帮助研究人员发现抗击肺炎病毒的药物。
[11.png
图片来自于@ Foldit,版权属于原作者
目前Foldit抗击肺炎病毒的活动来到第3轮,在页面右方可以下载游戏,Windows、Mac和Linux全平台支持。
12.png
图片来自于@ 小编,版权属于原作者
游戏下载安装完成后,我们来看看怎样才能上手吧。你可以在官网注册账号,用账号登陆游戏,你可以查看自己的得分和世界排名。Foldit上手需要了解一些病毒的基础知识,对于新手来说游戏的门槛其实不低,我们先从 Intro Puzzle 来练练手吧。新手关,你需要拖动侧链来避免冲突,只需要将左边的侧链往外拖动即可解决。
13.png
图片来自于@ 小编,版权属于原作者
当你渐入佳境之后,你可能会碰到从零开始设计蛋白质结构、解决冲突、蛋白空腔等问题。在你觉得脑洞已经打开之后,可以试着解决现实中的问题,在主菜单中选择 “Science Puzzles”。
14.png
排在第一位的就是冠状病毒,我们还可以往下拉,就能看到目前正在进行的第3轮Foldit抗击肺炎病毒的活动
15.png
在游戏中我们可以看到肺炎病毒的真实结构,为了能阻止病毒和人类受体相互作用,实现药物对于肺炎病毒的靶向攻击,大家需要设计一种和病毒开放侧链结合的蛋白质,将蓝色的侧链和水的结合断开,也就是说破坏蓝色侧链和水形成的稳定氢键(Hydrogen bonds)
16.png
那么玩Foldit真的能够解决实际问题吗,答案是肯定的!举个栗子,科学家们一直在尝试研究解构爱滋病的一项蛋白质“Retroviral Protease”长达15年,这种逆转录酶是爱滋病毒在活体细胞中复制和繁殖的关键。在Retroviral Protease上线Foldit之后,全世界的玩家们仅用10天时间搞定它的结构破解

文章参考: 特殊时期,我总想做点什么 —— [email protected] + Foldit把手举起来


文章作者: Spaceack
文章链接: http://spaceack.com/2020/04/08/2020-04-08-%E4%B8%BA%E6%8A%97%E5%87%BB%E7%97%85%E6%AF%92%E5%8A%A9%E5%8A%9B%EF%BC%8C%E4%BD%A0%E4%B9%9F%E5%8F%AF%E4%BB%A5/
版权声明: 本博客所有文章除特别声明外,均采用 CC BY-NC-SA 4.0 许可协议。转载请注明来自 丸子家的小云吞
支付宝打赏
微信打赏